Nhằm mục đích hiện đại hóa cơ sở điều trị để không ngừng nâng cao chất lượng khám chữa bệnh cho bệnh nhân, sau một thời gian chuẩn bị và vận hành thử, từ ngày 10/03/2008 máy chụp cộng hưởng từ đã chính thức được đưa vào hoạt động tại trung tâm kỹ thuật cao của bệnh viện Y học cổ truyền trung ương.
Cộng hưởng từ (MRI) là phương pháp chẩn đoán bệnh hiện đại, hiệu quả, chính xác, không độc hại, có giá trị rất cao trong chẩn đoán các bệnh lý sọ não, cột sống thắt lưng, cột sống cổ trong chuyên khoa thần kinh cũng như bệnh lý của lồng ngực, ổ bụng.
Cùng với việc đưa vào ứng dụng máy cộng hưởng từ phục vụ cho công tác chẩn đoán, Ban giám đốc bệnh viện đã bày tỏ quyết tâm tiếp tục đưa các thành tựu khoa học kỹ thuật mới vào ứng dụng trong công tác chẩn đoán và điều trị trong bệnh viện.